O autoteste de HIV, assim como os demais testes rápidos ofertados pelo SUS, detecta os anticorpos produzidos pelo corpo humano em resposta a infecção pelo HIV e não o vírus que causa o HIV. O período entre a infecção pelo HIV e a detecção desses anticorpos é denominado janela imunológica. Durante o período da janela imunológica os testes poderão apresentar resultados não reagentes (negativos), mesmo que a pessoa esteja infectada, portanto, atente-se a este período. Clique aqui para mais informações acerca da janela imunológica.

Os anticorpos podem estar presentes tanto no sangue, quanto no fluido oral. Dessa forma, existem autotestes que utilizam como amostra o sangue e outros que utilizam como amostra o fluido oral.