O Departamento de Doenças de Condições Crônicas e Infecções Sexualmente Transmissíveis (DCCI) atua no âmbito do SUS nas seguintes frentes: assistência, tratamento e prevenção às IST, ao HIV/aids e às hepatites virais. O DCCI é responsável por toda a gestão do fortalecimento da rede de atenção e linhas de cuidado desses agravos, bem como dos processos técnicos que envolvem laboratórios e suas inserções no diagnóstico, além de toda a gestão do aprimoramento e desenvolvimento da vigilância, informação e pesquisa sobre as infecções sexualmente transmissíveis, o HIV/aids e as hepatites virais.