Caracterização do polimorfismo genético no gene da protease do HIV-1 de subtipos B e C e seu impacto na susceptibilidade viral aos inibidores de protease.

Edital/Chamamento: 
Pesquisas Científicas - Abr/2002
Número do Projeto: 
683/2002

Pesquisador(es)

Pesquisador(es) Responsável(eis): 
Amilcar Tanuri

Instituição

Instituição: 
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Biologia, Departamento de Genética, Laboratório de Virologia Molecular Animal.
Parcerias institucionais: 
.
Período de Vigência: 
2002 – 2003
Situação: 
Concluída

Introdução e Justificativa

A maioria das infecções pelo HIV-1 no mundo está ocorrendo nos países em desenvolvimento, onde as cepas do subtipo B não são prevalentes. A meta principal deste estudo é acessar o impacto do polimorfismo genético restrito às variantes C de HIV-1, que pode alterar seu “fitness” replicativo e também alterar o fenótipo final de resistência aos inibidores de protease quando associados às mutações descritas para o subtipo B.

Objetivos

Acessar o impacto do polimorfismo genético restrito às variantes C de HIV-1 e se este pode alterar seu “fitness” replicativo e também o fenótipo final das mutações clássicas relacionadas à resistência aos inibidores de protease; Introduzir num clone infectivo de HIV-1 (pNL 43) do subtipo B, seis mutações no gene da protease (através da técnica de mutagênese sítio dirigida) escolhidas de acordo com as assinaturas moleculares consensuais do subtipo C (pNL 43 proC) estabelecidas pelo alinhamento das proteases de isolados do subtipo C de diferentes regiões sem mutações de resistência aos inibidores de protease; Transfectar os dois clones infectivos em células MT4 gerando os respectivos vírus; Utilizar os vírus B e C gerados para estudar de forma comparativa seu “fitness” replicativo. Para isso, os dois vírus serão cocultivados na mesma célula, de maneira controlada e será verificado o comportamento de cada população viral depois de oito passagens em cultura; e paralelamente, esses isolados B e C serão mutagenizados para adicionar as mutações características de resistência aos inibidores de protease. Será comparado o fenótipo induzido por essas mutações nos dois tipos de protease com a fenotipagem para os cinco inibidores de protease comerciais (amprenavir, saquinavir, ritonavir, indinavir e nelfinavir).

Materiais e Método

Análise das seqüências: utilizando um banco de seqüências do gene da protease de isolados C; Mutagênese sítio-dirigida: após obtenção de clone infectivo p NL 43proC, procede-se à inclusão das mutações clássicas de resistência aos inibidores de protease, tais como: L90M, V82A, I54V, M46I, G48V e D30N; Ensaios fenotípicos e de “fitness” viral: a detecção da resistência fenotípica será feita através da geração de um vírus recombinante. O clone recombinante gerado será utilizado num teste fenotípico com células MT4 com inibidores de protease comerciais.
Palavras-Chave: 
Subtipos. HIV-1. Fenotipagem. Genotipagem. Variação genética do HIV. Inibidores de protease.