O projeto foi concebido e realizado visando dois grandes objetivos: a concepção de ferramentas para criação e análise de indicadores dos dados clínicos e moleculares de pacientes HIV para gestão e tomada de decisão do Departamento de Vigilância, Prevenção e Controle das Infecções Sexualmente Transmissíveis, do HIV/Aids e das Hepatites Virais/Secretaria de Vigilância em Saúde/Ministério da Saúde e a Implementação do Teste de Genotipagem para detecção de mutações que geram resistência ao Inibidor de Entrada – Enfuvirtida – em pacientes submetidos ao HAART, mas sem tratamento prévio com esta classe de drogas. Dado os objetivos, as atividades realizadas foram divididas em dois subprojetos: CG 85014 e o CG 85001. No CG 85014, os principais objetivos eram: 1. Verificar o perfil de resistência do HIV-1 ao Enfuvirtida, através do sequenciamento genético do domínio HR1 da gp41 do envelope viral em pacientes virgens de tratamento para esta droga, mas com múltiplas falhas terapêuticas frente ao HAART; 2. Pesquisar a presença de mutações acessórias nos códons 126, 137 e 138 no domínio HR2 da gp41 do envelope viral já descritas previamente (SHAFER et al., 2003) e que aumentam a capacidade replicativa do HIV-1 (fitness viral). Para o total atingimento das metas, as principais atividades realizadas foram: capacitação técnica para entendimento do protocolo que permitirá verificar o perfil de resistência da gp41 do HIV-1 ao Enfuvirtida; capacitação para domínio e aplicação das técnicas de extração de material genético, da transcrição reversa do RNA viral, da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), da purificação do DNA obtido, da realização de gel de agarose a 1% para visualizar o fragmento alvo amplificado, da Reação de Sequenciamento Genético e da Genotipagem do HIV-1; identificação das associações entre mutações e resistência genotípica ao antirretroviral inibidor de Entrada (Enfuvirtida); No CG85001, o objetivo principal era: A construção de ferramentas para criação e análise de indicadores dos dados clínicos e moleculares de pacientes HIV para gestão e tomada de decisão do Departamento de Vigilância, Prevenção e Controle das Infecções Sexualmente Transmissíveis, do HIV/AIDS e das Hepatites Virais/Secretaria de Vigilância em Saúde/Ministério. Para o total atingimento das metas, foram realizadas as seguintes atividades: disponibilização dos sistemas DBCollHIV e HIVdag em produção e a geração de indicadores clínicos e moleculares. Atualização do algoritmo brasileiro para a análise de mutações de resistência nos genes de Protease e RT. Integração para identificação de mutações, tendo como entrada a sequência em formato FASTA. Aprimoramento da infraestrutura de serviços computacionais do algoritmo brasileiro e atualização de regras. Todas as etapas do CG85014 foram concluídas, e foi entregue o ensaio para a análise genotípica do domínio HR1/HR2 da gp41 frente ao Enfuvirtida em condições de ser utilizado pela Microrrede em questão e atender os pacientes previamente selecionados pelos médicos de referência em genotipagem do HIV1. Todas as etapas do CG85001 foram executadas e finalizadas, e as ferramentas propostas desenvolvidas e instaladas no ambiente montado. Os resultados gerados por tais ferramentas são objetos de pesquisa e poderão ser muito utilizados no apoio ao tratamento de pacientes HIV positivo. Além disso, a automatização dos algoritmos e a geração de indicadores proveem uma maior agilidade na avaliação de mutações e resistências os arquivos FASTA, colaborando com o trabalho dos pesquisadores e podendo ser utilizados para controle dos protocolos aplicados.